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西安地区2009年鼠类携带汉坦病毒的基因特征研究
引用本文:李恒新,马超锋,左署青,曹智伟,蔡正华,卢晓玲,曹务春.西安地区2009年鼠类携带汉坦病毒的基因特征研究[J].西安交通大学学报(医学版),2011,32(4):433-437,448.
作者姓名:李恒新  马超锋  左署青  曹智伟  蔡正华  卢晓玲  曹务春
作者单位:1. 西安市疾病预防控制中心,陕西西安,710054
2. 西安市疾病预防控制中心,陕西西安710054;西安交通大学医学院,陕西西安710061
3. 军事医学科学院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京100071
4. 陕西省户县疾病预防控制中心,陕西户县,710300
基金项目:国家自然科学基金面上项目,西安市科技计划项目
摘    要:目的研究西安地区2009年捕获鼠类种类和携带汉坦病毒情况,分析汉坦病毒的基因特征。方法在西安地区近年来肾综合征出血热高发的户县、长安两区县以夹夜法捕鼠,记录鼠种和生存环境。无菌解剖后取鼠肺提取总RNA,扩增汉坦病毒M片段基因进行病毒分型,选取部分阳性标本进行病毒S片段和L片段序列测定和进化分析。结果 2009年两区县捕获鼠类共400只,其中黑线姬鼠244只,占61%,褐家鼠89只,占22.25%,小家鼠43只,占10.75%,其他鼠种24只,占6%;共检出汉坦病毒核酸阳性鼠肺86只,分型以汉滩型为主,占79.07%;病毒L片段与贵州代表株同源性为95%~97%,S片段与贵州代表株同源性为97.7%~99.3%。结论 2009年西安地区汉坦病毒宿主以黑线姬鼠、褐家鼠、小家鼠为主,汉坦病毒核酸阳性率较高;所携带病毒以汉滩型为主,病毒进化分析与贵州代表株高度同源。

关 键 词:鼠种  汉坦病毒  基因分型  序列分析

Genetic characteristic analysis of Hantavirus from rodents in Xi'an China in 2009
LI Heng-xin,MA Chao-feng,ZUO Shu-qinga,CAO Zhi-wei,CAI Zheng-hua,LU Xiao-ling,CAO Wu-chun.Genetic characteristic analysis of Hantavirus from rodents in Xi'an China in 2009[J].Journal of Xi‘an Jiaotong University:Medical Sciences,2011,32(4):433-437,448.
Authors:LI Heng-xin  MA Chao-feng  ZUO Shu-qinga  CAO Zhi-wei  CAI Zheng-hua  LU Xiao-ling  CAO Wu-chun
Institution:LI Heng-xin1,MA Chao-feng1,2,ZUO Shu-qing3,CAO Zhi-wei3,CAI Zheng-hua1,LU Xiao-ling4,CAO Wu-chun3(1.Xi'an Center for Disease Control and Prevention,Xi'an 710002,China,2.Medical School,Xi'an Jiaotong University,Xi'an 710061,3.Beijing Institute ofMicrobiology and Epidemiology,State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity,Beijing 100071,4.Huxian Center for Disease Control and Prevention,Huxian 710030,China)
Abstract:Objective To study the captured murids in Xi'an in the year 2009 and the Hantavirus serotypes and genetic characteristics carried by these rodents.Methods Night trapping method was used to capture rats in Chang'an county and Hu county.Then we recorded the murids and their living environments,extracted RNA and genotyping of Hantavirus carried by the rodents,and sequenced the partial L and S segments to make the sequence alignment.Results Altogether 400 rats were captured in these two counties in 2009;Apodmus...
Keywords:murid  Hantavirus  genotyping  sequence analysis  
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