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RNA二级结构的数学表示及其应用
引用本文:白凤兰,徐丽. RNA二级结构的数学表示及其应用[J]. 大连交通大学学报, 2010, 31(6)
作者姓名:白凤兰  徐丽
作者单位:大连交通大学,理学院,辽宁大连116028;大连交通大学,理学院,辽宁大连116028
基金项目:辽宁省教育厅高等学校科研计划资助项目
摘    要:根据RNA二级结构的基本序列在3-D空间中定义了使核苷酸集与点集之间一一对应的映射,进而利用这个映射在3-D空间中得到了RNA二级结构的新的3-D有向图形表示,然后基于3-D有向图形表示把RNA二级结构转化为特征向量序列和L/L矩阵,提取特征向量序列的夹角余弦和的平均值和L/L矩阵的不变量(特征值),并作为特征向量来刻画RNA二级结构,最后利用特征向量之间的距离来描述序列或结构的不变性来分析了AIMV-3等九种病毒的RNA二级结构的相似性,得到了比较好的结果.

关 键 词:RNA二级结构  向量夹角  L/L矩阵  特征值

Mathematical Expression and Application of RNA Secondary Structures
BAI Feng-lan,XU Li. Mathematical Expression and Application of RNA Secondary Structures[J]. Journal of Dalian Jiaotong University, 2010, 31(6)
Authors:BAI Feng-lan  XU Li
Abstract:
Keywords:
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