家蚕滞育激素受体体外上调下游海藻糖酶基因的表达

家蚕滞育激素（Bombyx mori diapause hormone,BmDH）与滞育激素受体（BmDH receptor,BmDHR）结合,调控其信号通路中的下游基因的表达.在二化性家蚕中,受滞育信号的影响,蛹体卵巢膜上海藻糖酶的活性增强.为了证实 BmDHR对家蚕海藻糖酶基因（Bmtre）表达的调控作用,以 pcDNA3.1为载体,构建了4种由 ie -1启动子驱动的不同 Bmdhr 的表达质粒 pcDNA - ie1- Bmdhr1、pcDNA - ie1- Bmdhr3、pcDNA - ie1- Bmdhr4、pcDNA - ie1- Bmdhr5和（Bmtre 启动子驱动的萤火虫荧光素酶基因（luciferase,luc）报告质粒 p3Z - Bmtre - luc;用脂质体（Lipofectin）包埋1种 Bmdhr 表达质粒或不同摩尔比的 pcDNA - ie1- Bmdhr1/ pcDNA - ie1- Bmdhr5以及报告质粒后,分别共转染源于卵巢的家蚕细胞 BmN,在 DH 作用下体外检测 BmDHRs 对海藻糖酶基因启动子活性的影响.结果表明,4种滞育激素受体 BmDHR -1、BmDHR -3、BmDHR -4和BmDHR -5分别表达时,均能上调海藻糖酶基因启动子的活性;不同摩尔比（1：3,1：1,3：1）的 BmDHR -1/ BmDHR -5也均能上调海藻糖酶基因启动子的活性,由此证明 BmDHR 能上调其信号通路中下游基因 Bmtre 的表达.     

大蚕蛾科绢丝昆虫线粒体基因组A＋T丰富区序列及其系统发育研究

为了研究大蚕蛾科绢丝昆虫的进化关系,分别从蓖麻蚕、樗蚕和柳蚕的蛹中提取线粒体DNA,用PCR方法扩增线粒体A T丰富区及侧翼序列,克隆到pMD18-T载体,进行序列测定.序列分析表明,克隆片段的基因依次为12SrRNA基因3′端、A T丰富区、tRNAMet、tRNAIle、tRNAGln和ND2基因5′端,与家蚕和野桑蚕mtDNA排列顺序相同;在tR-NAGln和ND2基因之间有一段非编码区.根据柳蚕3个tRNA基因的核苷酸序列推定了其二级结构.基于5种大蚕蛾科绢丝昆虫和家蚕mtDNA A T丰富区序列的系统发育树显示,柳蚕与蓖麻蚕、樗蚕的亲缘关系较近,与柞蚕的亲缘关系较远,而与家蚕的亲缘关系更远.本研究结果有助于阐明大蚕蛾科绢丝昆虫以及家蚕的起源和进化.     

一种新的融合统计特征的DNA甲基化位点识别方法

自动、准确地识别DNA甲基化修饰位点对于研究基因的调控、转录和表达机理,有针对性地开发癌症靶向治疗药物有重要意义.然而,基于核酸频率统计特征和物化属性伪核酸成分统计特征并不能很好地反应DNA甲基化位点的模式信息,所构建的DNA甲基化位点预测器精度也不高.因此,文中提出从3个不同的视角抽取DNA序列上的核酸频次统计信息、位置统计信息和空间结构属性信息,并将其融合为一种新的统计特征向量,然后在相同的基础数据集上采用SVM分类器和严格的Jackknife测试方法进行实验验证.结果表明:该方法构建的预测器较当前最好的iDNA-methyl预测器,在Acc、Mcc和AUC 3个性能指标上分别提高了11.85%、24%和11.3%;该研究表明在DNA甲基化位点预测问题上,核酸序列的频次统计信息、位置统计信息和空间结构属性信息具有较好互补性,这3个视角相融合得到的特征向量能够更好地反映DNA甲基化修饰位点的模式特征,提高DNA甲基化位点的预测精度.