基于近似约简的基因选择方法

为了对癌症等疾病分型、诊断及进行病理学研究,利用基因微阵列数据识别疾病相关基因.考虑到了基因微阵列数据是典型的矛盾决策系统,在证明矛盾系统在近似分布集上是协调的这一事实的基础上提出了一套近似分布约简理论,讨论了不同近似分布集上约简之间的关系,提出了基于近似约简的基因选择方法.使用两组真实的基因表达数据对所提出的方法进行了验证.实验结果表明,该方法能在保持分类能力的情况下降低特征基因集的相关性,从而显著地减少特征基因的数量.     

壶腹周围癌细胞核DNA含量测定与临床意义

在对 6 7例壶腹周围癌患者回顾性调查的基础上 ,采用 Feulgen′s染色方法和自动图像技术 ,定量测定了癌细胞核 DNA含量。结果 :(1) DNA非整倍体在壶腹周围癌中的发生率为 71.6 4 % ,且其发生率随组织学分级而上升 ;非整倍体肿瘤的预后远不如整倍体肿瘤 (P <0 .0 5) ;(2 )生存期≥ 3年和 <3年组的 DNA指数均值 (DI)有显著性差异 (P <0 .0 1) ;(3)按患者 DNA主干系峰位的 DNA指数值分为三种峰型 ,I型峰预后最好 , 型峰最差。提示 :DNA含量变化与组织学分级有密切关系 ,可作为壶腹周围癌常规临床病理的补充 ;非整倍体和 DNA指数 >3预示壶腹周围癌预后不良 ;DNA含量测定有助于判断预后 ,筛选高危复发转移病人 ,指导临床治疗。     

大蚕蛾科绢丝昆虫线粒体基因组A＋T丰富区序列及其系统发育研究

为了研究大蚕蛾科绢丝昆虫的进化关系,分别从蓖麻蚕、樗蚕和柳蚕的蛹中提取线粒体DNA,用PCR方法扩增线粒体A T丰富区及侧翼序列,克隆到pMD18-T载体,进行序列测定.序列分析表明,克隆片段的基因依次为12SrRNA基因3′端、A T丰富区、tRNAMet、tRNAIle、tRNAGln和ND2基因5′端,与家蚕和野桑蚕mtDNA排列顺序相同;在tR-NAGln和ND2基因之间有一段非编码区.根据柳蚕3个tRNA基因的核苷酸序列推定了其二级结构.基于5种大蚕蛾科绢丝昆虫和家蚕mtDNA A T丰富区序列的系统发育树显示,柳蚕与蓖麻蚕、樗蚕的亲缘关系较近,与柞蚕的亲缘关系较远,而与家蚕的亲缘关系更远.本研究结果有助于阐明大蚕蛾科绢丝昆虫以及家蚕的起源和进化.     

国人D17S30遗传多态性研究

采用基因扩增结合电泳银染技术分析１３０名汉族群体ＤＮＡＤ１７Ｓ３０遗传多态性，发现了１３个等位基因，基因频率为０．００７８～０．３５３８，有４２种基因型，其观察值和期望值经Ｘ２检验符合Ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡定律；３个家系的９名成员Ｄ１７Ｓ３０遗传学分析，符合孟德尔遗传学规律。表明ＤＮＡＤ１７Ｓ３０在国人汉族群体具有高度多态性，在医学基因诊断、遗传学研究和法科学个人识别、亲权鉴定等领域是非常有价值的遗传标记。     

HSV-1截短gB基因DNA疫苗的构建及初步鉴定

目的　为有效预防单纯疱疹Ⅰ型病毒 (HSV - 1 )感染 ,给多价DNA疫苗的构建奠定基础 ,构建表达截短HSV - 1 gB糖蛋白的DNA疫苗。方法　用PCR技术从HSV - 1基因组中扩增出编码HSV 1gB糖蛋白 1 - 5 1 7氨基酸序列的一段基因序列 ,通过 pGEM -T中介载体 ,将其插入到真核表达质粒pcDNA 3 1 (+)的CMV启动子下游。结果　构建的重组真核表达质粒可在动物体内正确表达目的基因 ,对HSV - 1病毒攻击具有免疫保护作用。结论　本研究对截短HSV - 1 gB基因DNA疫苗进行了初步的探索性研究 ,也为多价HSV 1DNA疫苗的构建奠定了基础。     

Combined Effects of Cadmium and Phenanthrene on DNA Sequence Diversity of Soil Microbial Community

Pollution of soil environment has become a se-rious problem in many countries, including China.Heavy metal (HM) and polycyclic aromatic hydro-carbons (PAHs) are two of the most abundant andpotentially harmful pollutants found in most pol-luted soil[1, 2]. Besides their natural occurrence,heavy metals may enter the soil environmentthrough anthropogenic activities, such as mining,smelting, sewage sludge disposal, application ofpesticides and inorganic fertilizers, and atmospher-ic deposition. …     

人体硬组织DNA遗传多态性的研究

用ＰＣＲ扩增片段长度多态性技术分析了３０５名汉族人群ＶＮＴＲ位点ＤＩＳ８０、Ｄ１７Ｓ３０遗传多态性，结果发现：ＤＩＳ８０有２２个等位基因，基因频率０．５７～３３．１４，杂合度８２．６３％；Ｄ１７Ｓ３０有１３个等位基因，基因频率０．７８～３５．８８，杂合度８２．６３％。家系分析证实，这些ＶＮＴＲ位点等位基因遗传符合孟德尔遗传规律。同时对同一个体的血－骨、血－牙样本ＤＮＡ进行研究，均获得一致性分析结果。表明骨牙ＤＮＡ分析完全可以代表软组织的基因分析应用于个体识别和遗传学研究等领域。     

200例国人DNA纹印基因频率分布—D2S44及D17S79位点的DNA多态性

DNA 纹印具有高度多态性,是解决个体识别及亲子鉴定等问题的最新技术.本文利用此项技术,研究了200名国人的D2S44及D17S79二位点的等位基因频率分布.结果发现D2S44位点片段带大小变异数为29,其中可检出两个等位基因团.一在7.7和9.1kb 之间,最常见于8.0kb,另一在9.8和14.1kb 之间,最大频率在11.1kb,占17.25%。D17S79位点片段带大小变异数为27,等位基因团在约4kb大小的范围内,最大频率在3.4kb,占29.55%.与国外报道结果相比,显示种族差异.     

结核杆菌DnaA蛋白的原核表达及免疫血清的制备和检测

目的 在大肠杆菌中表达重组结核杆菌DnaA蛋白,对表达产物进行纯化、鉴定后制备DnaA蛋白特异性免疫血清并进行Western blot检测.方法 以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv基因组为模板,PCR扩增DnaA基因,构建DnaA原核表达质粒pET-DnaA,转化表达宿主大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导重组蛋白表...     

单纯疱疹病毒Ⅰ型DNA中BamHIC片断结构和功能的研究——Ⅰ.BamHI C片断的次级克隆和酶谱分析

运用DNA重组技术对单纯疱疹病毒Ⅰ型(HSV-1)DNA分子的BamHI C片断进行了次级克隆,建立了该基因片断中8个片断的无性繁殖系。同时利用核酸限制性内切酶的多酶解技术,对该片断作了酶谱分析。