两种实时定量RT-PCR方法检测miRNAs表达的技术分析

目的比较两种实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)方法检测microRNAs(miRNAs)表达含量的技术差异,优化不同实验目的和条件下研究miRNAs表达的技术方法。方法取21d和42d两个时间点的SD大鼠关节软骨组织,采用Trizol法提取总RNA备用。选取rno-miR-15b、rno-miR-16、rno-miR-195、rno-miR-497作为研究对象,分别用茎环引物和试剂公司提供的试剂盒方法反转录总RNA,并应用实时定量PCR方法检测这些miRNAs的表达量。提取人血浆中总RNA,用上述两种RT-qPCR方法实时定量检测has-miR-16的表达量。结果两种方法检测这些miRNAs表达量,在大鼠21d和42d这两个时间点其表达量变化趋势相同,都呈现增高的趋势,这与我们前期Solexa测序结果相同。在血浆中的结果显示,其中茎环引物反转录方法灵敏度相对较高。结论茎环引物法在少量几个重要的miRNAs检测中具有优势,而试剂盒方法适用于大量miRNAs的筛查。     

临床致病性不动杆菌的分子生物学鉴定

目的对临床致病性不动杆菌进行种属鉴定,并比较3种方法(44℃生长试验、特异性引物PCR扩增和16SrRNA测序)对鲍曼不动杆菌鉴定的特异性、准确性及应用价值。方法收集临床致病不动杆菌56株,首先接种在胰蛋白胨大豆肉汤中44℃进行培养,观察是否可以生长;其次,提取56株不动杆菌基因组DNA,用两组不同的特异性引物进行PCR扩增鉴定;最后,用通用引物对56株不动杆菌的16SrRNA进行测序鉴定。结果 56株不动杆菌中有17株可在44℃生长。经特异性引物PCR扩增鉴定,发现8株鲍曼不动杆菌和3株13TU型不动杆菌均可在44℃中较早较快生长。金标准16SrRNA测序确定56株不动杆菌中含有9个种,其中鲍曼不动杆菌和13TU型不动杆菌的鉴定结果与特异性引物PCR扩增法相同。结论应用分子生物学方法鉴定鲍曼不动杆菌具有准确、高效且可重复性高的优点,尤其是特异性PCR扩增法,可作为较难诊断的鲍曼不动杆菌的首选鉴定方法。     

反义寡核苷酸抑制人恶性黑素瘤A375细胞survivin mRNA及其蛋白的表达

目的研究survivin反义寡核苷酸(ASODN)对人恶性黑素瘤A375细胞survivin mRNA及蛋白表达的影响。方法人工合成survivin ASODN,脂质体介导转染人恶性黑素瘤细胞株A375,采用原位杂交、免疫组化SP法检测survivin mRNA及其蛋白表达的变化。结果转染24 h后,ASODN组A375细胞survivin mRNA表达较对照组显著下调(P<0.01);转染48 h后,与对照组相比,ASODN组细胞的survivin蛋白水平显著下降(P<0.01)。结论Survivin ASODN可下调A375细胞survivin mRNA的表达和survivin蛋白水平。     

新型纳米金荧光双标survivin反义寡核苷酸探针的合成及其对人恶性黑素瘤A375细胞的影响

目的利用纳米金独特的生物和光学特性,合成一种新型纳米金荧光双标survivin反义寡核苷酸探针,观察其对人恶性黑素瘤A375细胞的影响。方法用柠檬酸钠还原法制备纳米金,将巯基修饰后的survivin反义寡核苷酸结合在纳米金表面,合成纳米金survivin反义寡核苷酸探针;再结合互补的带荧光标记的报告序列,制成纳米金荧光双标survivin反义寡核苷酸探针;将制备的探针转染人恶性黑素瘤A375细胞,荧光显微镜观察细胞内荧光图像,MTT法及流式细胞仪检测A375细胞的增殖及凋亡情况。结果制备的纳米金荧光双标survivin反义寡核苷酸探针转染A375细胞后,可观察到清晰的细胞内荧光图像,可以抑制A375细胞的增殖,与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05),诱导细胞凋亡增多。结论寡核苷酸功能化的纳米金颗粒可有效转染进人恶性黑素瘤A375细胞,通过反义封闭作用诱导人恶性黑素瘤A375细胞凋亡增多。     

探索不断有发现的microRNA世界

研究产品：MicroRNAs（miRNAs）是一类近年来发现在基因调控中发挥重要作用的生物分子。MiRNA的长度很短——18到24个核苷酸——这意味着标准的寡核苷酸检测探针针对miRNA靶点没有足够的亲和力和特异性。目前解决这些不足，并且越发受到公众认可的一种方式就就是使用高亲和力的核酸类似物锁核酸（LNATM），这是基于Exiqon公司miRCURY^TM LNA技术的基础。含有LNA的寡核苷酸针对它们的miRNA靶点具有难以想象的高亲和力和特异性，这与其显著提高的熔化温度（Tin’s）和优化的错配分辨能力是分不开的。     

聚合酶链反应检测弓形虫核酸的研究

应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术，设计了一对寡核苷酸引物，对弓形虫Ｂ１基因的保守序列进行体外扩增，显示该引物只对弓形虫核酸扩增，可对４个或４个以上弓形虫扩增出明显条带，检测弓形虫核酸的最低量为２．５ｐｇ。该ＰＣＲ对急性感染弓形虫的小鼠，于４８ｈ后就可从部分小鼠（２／５）的外周血中检测到弓形虫核酸，９６ｈ后全部小鼠（５／５）外周血中均检测到弓形虫核酸，而感染２４ｈ后可从其肝、脾、肾等组织中扩增到弓形虫核酸。对３４例孕妇外周血分别用ＥＬＩＳＡ及ＰＣＲ平行检测，ＥＬＩＳＡ测ＩｇＭ阳性者３例，ＰＣＲ扩增阳性者６例（其中３例ＩｇＭ亦阳性），表明ＰＣＲ具有较高的敏感性和特异性。     

Ki-Ras反义寡核苷酸对人胃癌细胞及血管内皮细胞的作用

:目的　用Ki Ras的反义寡核苷酸 (ASODN)作用于人胃癌细胞和血管内皮细胞 ,为其抑制胃癌生长及其内血管生成进行前期基础研究。方法　MTT法观察Ki RasASODN对两种细胞增殖的影响 ,电镜下观察细胞的超微结构变化及有无凋亡发生。结果　Ki RasASODN可明显抑制人胃癌细胞和血管内皮细胞的增殖。在一定剂量下还可诱发细胞凋亡。结论　Ki RasP2 1在人胃癌细胞和血管内皮细胞的增殖与凋亡调控中具有重要作用。     

反义寡核苷酸转染A375细胞实验条件的优化

目的研究不同的转染条件下,Survivin反义寡核苷酸(ASODN)对体外培养的人恶性黑色素瘤细胞A375生长的影响。方法通过对ASODN进行硫代修饰、脂质体运转及培养条件的改变,用倒置显微镜、台盼蓝计数观察Survivin ASODN对A375细胞增殖的抑制作用。结果硫代修饰ASODN经脂质体包裹对细胞生长抑制作用明显强于未经脂质体包裹组(P<0.01);②细胞培养6 h贴壁后进行转染对细胞的生长抑制率明显高于24 h后进行转染(P<0.05);③转染期间(4 h)无血清存在组与相应对照组比较差异有显著性意义(P<0.01);④ASODN转染后12-72 h,对细胞的抑制效应逐渐升高,72 h达顶峰,之后开始回落;⑤与混杂组(SODN)及错配组(MODN)相比,反义组在各个浓度对细胞生长抑制作用最明显,各浓度组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论许多因素影响ASODN的转运,不同的实验应选择不同的实验优化条件。     

脂质体介导c-myc反义寡核苷酸对人肝癌裸鼠移植瘤生长的影响

目的　观察脂质体 (LR)介导c myc反义寡核苷酸 (ASODN)对高表达基因c myc的人肝癌细胞SMMC 772 1裸鼠移植瘤生长的影响。方法　人肝癌细胞株SMMC 772 1以 1.5× 10 6 分别接种于裸鼠背部皮下 ,第 14天均生长出瘤结节 [大小为 (4± 1)mm]后 ,分为实验组、空白对照组和错配链寡核苷酸对照组三组。实验组用脂质体包裹的10 μmol·L- 1 浓度ASODN每天一次直接瘤体注射 ,连用 5d ,观察 2 8d。结果　测量裸鼠瘤体外表 ,发现第 5天ASODN组瘤体明显小于对照组 (P <0 .0 5 ) ,瘤质量在第 2 8天后ASODN组明显轻于对照组 (P <0 .0 5 )。组织学HE染色显示瘤体组织在实验组较对照组坏死明显 ,免疫组化结果显示C myc蛋白表达在实验组较对照组降低。 结论　推测应用脂质体包裹ASODN可能对人肝癌细胞SMMC 772 1成瘤的组织细胞生长有一定的抑制作用