扩展奇偶规则的元胞自动机模型和分析

对奇偶规则的元胞自动机模型，进行了大量的计算机实验，引入Hamming距离和总密度关联，并对其演化作了数据分析．通过对奇偶规则的元胞自动机的研究，提出了一种扩展奇偶规则的元胞自动机，对它的演化规则进行了研究，并对这种模型的Hamming距离和总密度关联也作了深入的讨论和计算机模拟．     

蛋白质结构预测二维连续模型研究

利用模拟退火算法解NP完全问题的有效性，对新近提出的蛋白质结构预测问题的二维连续模型作了另解，并基于平面表达的清晰与美观将原模型作了相应的修改．最后，比较了模拟退火算法与原拟物算法的优劣，指出了另解具有的几个优点：去掉了物理背景，只作为一个纯数学问题来求解，有利于在计算机上实现；模拟退火算法收敛速度更快且精度更高。     

DNA序列分析的高效算法研究及比较

对海量数据的处理，最有效的方法是并行计算。因此，对DNA序列比对进行并行化，以及对BLAST算法进行并行化改进，以提高对大数据量处理的能力，尽管在CLUSTER上的计算效率较超级计算机上的效率低。但CLUSTER较超级计算机费用低，有较大的适用性，而高性能计算机是处理海量数据的强有力的工具，生命科学中计算问题必须进行超级计算已是不争的事实，现代生命科学对超级计算已显示出强烈依赖和迫切需求，文中对BLAST算法进行改进，提出一种局部并行化的DNA序列比对算法，为了检验算法的科学性和适用性，将此算法与超级计算机的高效并行算法——改进的FFT算法相比较及分析。     

基于行动的大学数学课程网络学习系统

介绍了基于行动的大学数学课程网络学习系统的结构和特点，并分析了基于行动的大学数学课程网络学习系统在数学教学中的作用和地位。     

蛋白质折叠过程中自回避搜索的算法研究

蛋白质折叠是一个复杂的演化过程。目前广泛采用HP格子模型，可以使分子内部连续的结构空间离散化，减少分子内部的自由度，从而较有效地研究蛋白质的折叠机理。在格子模型中，自回避路径的确定是搜索折叠构象的关键。文章在基于二维HP格子模型基础上，提出了一种简捷快速的自回避路径搜索算法，并在计算机上进行实例检测及模拟，产生效果较好的蛋白质折叠构象。但对于长序列，自回避路径折叠搜索计算时间将呈指数增长。为了更真实地模拟蛋白质折叠过程，文章进一步探讨了建立并行HP格子模型思路，对较长序列的折叠，其折叠过程不会因为序列长度的增加而快速增大模拟的复杂度，且符合生命的演化规律。