生物信息学方法大规模筛选肿瘤差异表达基因

目的 利用数据库中已有的基因信息快速筛选鉴定出潜在的肿瘤相关基因.方法 利用EST数据库中的基因信息,采用数字化差异显示(DDD)方法,对17种不同肿瘤组织的全基因组进行筛选.结果 获得了130个上调基因和159个下调基因,大多为编码细胞骨架蛋白、核糖体亚单位的基因以及与物质代谢、细胞周期、信号传导、调节转录和翻译过程有密切关系的基因.这些基因在12号染色体上出现频率最高,而在21号和Y染色体上很少出现.结论 生物信息学筛选是一种快速有效的筛选方法.本实验所得结果对今后肿瘤标志物的鉴定奠定了基础,也为肿瘤标志物的筛选策略提供了新的思路.

In silico identification of cancer genes by high throughput analyses