| 人肺腺癌细胞系A549细胞双向电泳-飞行时间质谱研究 |
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| 引用本文： | 杨拴盈,田应选,南岩东,卜丽娜,霍树芬,阮禹松.人肺腺癌细胞系A549细胞双向电泳-飞行时间质谱研究[J].西安交通大学学报(医学版),2007,28(4):422-426. |
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| 作者姓名： | 杨拴盈 田应选 南岩东 卜丽娜 霍树芬 阮禹松 |
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| 作者单位： | 1. 西安交通大学,医学院第二附属医院呼吸科,陕西西安,710004
2. 西安交通大学,生命科学与技术学院,陕西西安,710049 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;陕西省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 目的初步分析人肺腺癌细胞系A549细胞蛋白质表达情况,从蛋白组水平探讨肺腺癌发病的分子机制。方法应用2-DE技术对人肺腺癌细胞系A549细胞总蛋白进行分离,获得蛋白质表达谱;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)结合生物信息学进行蛋白质鉴定。结果3块胶平均蛋白斑点数为1 138±49,平均匹配点数为986±32,匹配率为85.8%。随机选取背景清晰、分辨清楚、蛋白含量较高的20个斑点进行MALDI-TOF-MS分析,共获得了18个肽质量指纹图谱(PMF)。将PMFs质量数据通过Aldente软件查询SWISS-PROT数据库,根据匹配片段及氨基酸序列覆盖率等,初步鉴定出15种蛋白质。根据功能,这些蛋白质可分为:①基本代谢相关的酶类:果糖2-磷酸醛缩酶、视网醛脱氢酶1(RALDH1)、吡多醛激酶;②细胞骨架类:蛋白细胞角蛋白8(CK8)、-β2链微管蛋白;③应激相关蛋白:蛋白二硫化物异构酶A3(PDIA3);④信号转导分子:膜联蛋白1(ANX1)、膜联蛋白4(ANX4);⑤分子伴侣:热休克蛋白60(HSP60)、热休克蛋白-β1、抑制素(PHB);⑥转录及翻译相关蛋白:不均一性核糖核蛋白H(hnRNP H);⑦杂类:Rgr protein、NPM、PCBP1。结论应用2-DE/MALDI-MS方法获得了较为理想的人肺腺癌细胞系A549细胞2-DE蛋白质表达谱,初步鉴定了15种蛋白质。
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| 关 键 词： | 人肺腺癌细胞系 蛋白质组学 双向电泳 基质辅助激光解吸离子化电离飞行时间质谱 肽指纹图谱 |
| 文章编号： | 1671-8259（2007）04-0422-05 |
| 修稿时间： | 2007-03-29 |
A proteomic study on human lung adenocarcinoma cell line A549 by 2-DE and MALDI-TOF-MS |
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| Yang Shuanying,Tian Yingxuan,Nan Yandong,Bo Lina,Huo Shufen,Ruan Yusong.A proteomic study on human lung adenocarcinoma cell line A549 by 2-DE and MALDI-TOF-MS[J].Journal of Xi‘an Jiaotong University:Medical Sciences,2007,28(4):422-426. |
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| Authors: | Yang Shuanying Tian Yingxuan Nan Yandong Bo Lina Huo Shufen Ruan Yusong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | human lung adenocarcinoma cell line proteomics two dimensional gel electrophoresis matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry(MALDI-TOF-MS) peptide mass fingerprinting |
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