| 基于Gauss-EMD的DNA序列相似性分析 |
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| 引用本文： | 郑俊生,张继红,马李昕.基于Gauss-EMD的DNA序列相似性分析[J].大连交通大学学报,2013,34(1):98-102. |
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| 作者姓名： | 郑俊生 张继红 马李昕 |
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| 作者单位： | 1. 大连东软信息学院计算机科学与技术系,辽宁大连,116023
2. 大连交通大学理学院,辽宁大连,116028 |
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| 摘 要： | 提出了高斯-经验模态分解(Gauss-EMD)算法,在固有模态函数筛选过程中,用高斯径向基函数插值极值包络线,并将该算法应用于DNA序列的相似性分析当中.这个方法可以简单直观地通过分析DNA序列的余量来分析序列的相似性,通过四个物种线粒体DNA序列实例验证了新算法相较于经典的经验模态分解算法更适用于DNA序列的局部相似性分析.
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| 关 键 词： | 经验模态分解(EMD) 高斯径向基函数 固有模态函数(IMF) DNA序列 |
Similarity Analysis of DNA Sequences Based on Gauss-EMD Method |
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| ZHENG Jun-sheng
,
ZHANG Ji-hong
,
MA Li-xin.Similarity Analysis of DNA Sequences Based on Gauss-EMD Method[J].Journal of Dalian Jiaotong University,2013,34(1):98-102. |
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| Authors: | ZHENG Jun-sheng ZHANG Ji-hong MA Li-xin |
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| Institution: | 1(1.Dept.of Computer Science,Dalian Neusoft Institute of Information,Dalian 116023,China;2.School of Mechanical Engineering,Dalian Jiaotong University,Dalian 116028,China) |
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| Abstract: | |
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