| 基于序列预测蛋白质和RNA的相互作用 |
| |
| 引用本文： | 汪颖,李享云.基于序列预测蛋白质和RNA的相互作用[J].大连交通大学学报,2015,36(4). |
| |
| 作者姓名： | 汪颖 李享云 |
| |
| 作者单位： | 大连交通大学理学院,辽宁大连,116028 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，辽宁省教育厅高等学校科学研究计划资助项目 |
| |
| 摘 要： | 从计算的角度出发,考虑到当前蛋白质和RNA相互作用数据的实际情况,基于蛋白质和RNA的序列成分信息,构建预测模型.通过来自PDB的3149个蛋白质-RNA相互作用对得到的氨基酸三联体-核苷酸的相互作用倾向性值,定义了一个权重倾向性度量,用来度量每一对蛋白质-RNA序列中三联体-核苷酸的相互作用倾向性.为了避免特征的冗余性,基于较高倾向性以及成分特征构建特征向量,用于预测蛋白质-RNA相互作用.计算结果显示文中预测模型(SVM模型)和算法的有效性.
|
| 关 键 词： | 蛋白质 RNA 相互作用 相互作用倾向性 |
Prediction of Protein-RNA Interactions based on Sequence Information |
| |
| WANG Ying,LI Xiang Yun.Prediction of Protein-RNA Interactions based on Sequence Information[J].Journal of Dalian Jiaotong University,2015,36(4). |
| |
| Authors: | WANG Ying LI Xiang Yun |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | protein RNA interaction interaction propensity |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
