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U6和let-7a作为定量检测miRNAs的内参在大鼠软骨中稳定性的比较
作者单位:;1.西安交通大学医学部附属红会医院急诊科;2.西安交通大学医学部基础医学院生物化学与分子生物学系;3.环境与疾病相关基因教育部重点实验室
摘    要:目的比较U6和let-7a两种内参在RT-qPCR方法检测大鼠股骨头软骨样本microRNAs(miRNAs)的稳定性。方法取软骨生成过程的新生(D0)、断乳(D21)、性成熟(D42)3个时间节点的雌性近交系DA大鼠股骨头软骨,提取总RNA,用RT-qPCR方法分别在U6和let-7a两种内参体系下,检测miR-1、-25、-26a、-140、-146a、-150、-181a、-195、-223、-337等的表达,并与课题组前期获得的二代测序绝对定量结果进行比较,综合评价两种内参的稳定性。结果在D42样本中U6(P=0.045)、let-7a(P=0.021 5)的相对值出现了显著性差异;在两种内参体系中miR-26a、-140、-223、-337的表达趋势相同,miR-1、-146a差异无统计学意义,miR-25、-150、-181a、-195都出现了显著性差异(P<0.05)。综合二代测序绝对定量结果比较,let-7a稳定性优于U6。结论 let-7a稳定性优于U6,更适合做软骨miRNA定量的内参。


Comparison between Let-7a and U6 as an internal reference for RT-qPCR of miRNAs in rat cartilage
Abstract:
Keywords:软骨  内参  RT-qPCR  U6  Let-7a  microRNAs(miRNAs)
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