糖尿病性心肌病小鼠心肌线粒体circRNA表达谱与功能富集分析 |
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引用本文: | 王毅,尤红俊,韩稳琦,刁佳宇.糖尿病性心肌病小鼠心肌线粒体circRNA表达谱与功能富集分析[J].西安交通大学学报(医学版),2023(5):701-708. |
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作者姓名: | 王毅 尤红俊 韩稳琦 刁佳宇 |
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作者单位: | 陕西省人民医院心内二科 |
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摘 要: | 目的 探索糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy, DCM)小鼠心肌线粒体circRNA的差异表达情况及其功能分析。方法 以16周龄的db/db小鼠构建DCM小鼠模型,C57BL/KsJ小鼠作为对照。提取两组小鼠心肌组织RNA,高通量测序筛选两组差异表达的线粒体circRNA,使用RT-qPCR对差异表达显著的前10个circRNA验证测序结果,并对差异表达circRNA靶基因作功能富集分析,使用miRNA靶标预测软件对circRNA-miRNA共表达网络分析。结果 与对照组比较,DCM组小鼠心肌中147个差异表达的线粒体circRNA,其中高表达89个、低表达58个。差异表达circRNA在组织中的表达变化与测序结果趋势一致。GO与KEGG富集分析显示,差异表达的circRNA靶基因主要富集在cGMP/PKG、胰高血糖素等通路,与线粒体能量代谢、心肌肥大相关。circRNA-miRNA共表达网络分析发现,表达上调最显著的chrM:1207-1536+与miR-491-3p、miR-99a-3p、miR-99b-3p有关联,表达下调最显著的chrM:1453-3...
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关 键 词: | 糖尿病性心肌病 线粒体 circRNA |
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