| SELEX筛选骨肉瘤HER2适配体方法的建立 |
| |
| 引用本文： | 陈孜,徐又佳,李光飞,张鹏,沈光思.SELEX筛选骨肉瘤HER2适配体方法的建立[J].西安交通大学学报(医学版),2014,35(5). |
| |
| 作者姓名： | 陈孜 徐又佳 李光飞 张鹏 沈光思 |
| |
| 作者单位： | 1. 苏州大学附属第二医院骨科,江苏苏州 215004;南京大学附属常州第二医院骨科,江苏常州213000
2. 苏州大学附属第二医院骨科,江苏苏州,215004 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，the National Natural Science Foundation of China |
| |
| 摘 要： | 目的应用SELEX(system evolution of ligands by exponential enrichment)技术筛选与HER2特异性结合的寡聚核酸适配体(aptamer)。方法体外合成了长度为78个碱基并含有35个随机寡核苷酸的ssDNA文库,通过生物素-链亲和素磁珠系统分离法制备次级ssDNA文库,且经以微孔为介质的SELEX正反筛法获得了与HER2特异性结合的DNA适配体;同时利用生物素-链霉亲和素-辣根过氧化物酶系统检测每轮ssDNA与靶蛋白HER2的亲和力,将亲和力最高的适配体群进行克隆、测序。最后利用生物学软件DNAMAN对适配体群进行了一级结构和二级结构的分析,同时将亲和性最高的适配体做了进一步的特异性的检验。结果经过12轮的筛选,获得了与HER2蛋白具有极高亲和力的适配体9号,亲和力从初始的0.18上升至0.86,提高了约5倍。特异性结果显示,9号适配体只与HER2具有较高的特异性。结论经过多轮的筛选,成功获得了特异性识别骨肉瘤HER2蛋白的单链DNA适配体,为骨肉瘤的诊断和治疗奠定了基础。
|
| 关 键 词： | SELEX技术 骨肉瘤 HER2 DNA适配体 |
Establishment of screening osteosarcoma HER2 aptamer method by SELEX |
| |
| CHEN Zi,XU You-jia,LI Guang-fei,ZHANG Peng,SHEN Guang-si.Establishment of screening osteosarcoma HER2 aptamer method by SELEX[J].Journal of Xi‘an Jiaotong University:Medical Sciences,2014,35(5). |
| |
| Authors: | CHEN Zi XU You-jia LI Guang-fei ZHANG Peng SHEN Guang-si |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | SELEX technology osteosarcoma HER2 DNA aptamer |
|
|
