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应用基因芯片技术筛选克山病差异表达基因
引用本文:王 斌,何淑兰,雷艳霞,等.应用基因芯片技术筛选克山病差异表达基因[J].西安交通大学学报(医学版),2014(2):163-168.
作者姓名:王 斌  何淑兰  雷艳霞  
作者单位:;1.西安交通大学医学院公共卫生系;2.环境与疾病相关基因教育部重点实验室
摘    要:目的应用基因芯片技术筛选克山病(Keshan disease,KD)患者和正常对照者外周血差异表达基因并对其进行分析,探讨KD发病的分子机制。方法收集16例KD患者和16例病区健康对照外周血样品,提取总RNA,纯化后合成cRNA探针;采用Agilent全基因组表达芯片检测基因表达的差异,以SAM4.0软件,结合IPA软件比较KD患者和正常对照个体外周血中的基因表达谱差异、功能及通路分析。结果与对照组相比,KD患者血样中差异表达基因上调的有59个,下调的有19个,基因功能主要涉及代谢、转录、离子通道与运输蛋白、蛋白质的合成与修饰、信号转导等;生物功能主要涉及细胞凋亡、细胞功能修复、分子转运、细胞增殖和分化、细胞间信号转导等。网络蛋白介导的内吞作用是差异最显著的通路。结论 KD患者外周血单核淋巴细胞多个差异表达基因显著不同于正常人,主要涉及细胞增殖、细胞凋亡、细胞功能修复等,这些基因可能在克山病发生发展中发挥重要的作用。

关 键 词:克山病  基因芯片  差异表达基因  外周血

Microarray-based gene expression profiles related to Keshan disease
Abstract:
Keywords:
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